文章简介:
本文通过单细胞多组学技术和空间转录组技术对患有唐氏综合征(Ts21)的胎儿以及正常胎儿的骨髓和肝脏进行分析,构建了Ts21胎儿造血异常的高分辨率分子图谱。
样本策略:scRNA-seq(15名Ts21胎儿和3名正常胎儿的肝脏和骨髓),snRNA-seq+scATAC-seq(3名Ts21胎儿和正常胎儿的肝脏),空间转录组测序(11名Ts21胎儿和5名正常胎儿的肝脏)。
应用技术:
scRNA-seq、snRNA-seq+scATAC-seq、空间转录组测序、流式细胞术等。
研究亮点:
(1) 发现Ts21中基因表达的差异取决于细胞类型和环境,其中造血干细胞(HSCs)呈现“预分化”状态;
(2) Ts21通过Ts21通过改变染色质可及性与基因表达之间的相关性,重构了调控元件-基因景观;
(3) 重构影响了对红系分化至关重要的增强子活性和基因表达,以及与红细胞系分化相关的调控网络;
(4) 验证了Ts21中观察到的线粒体质量增加和氧化应激现象,以及这些突变倾向于发生在HSCs表达基因的调控区域。
研究意义:本研究不仅拓展了对唐氏综合征胎儿造血异常的理解,还为唐氏综合征相关的血液疾病提供了潜在的分子机制,这对于开发新的治疗策略具有重要意义。
文献原文(DOI):10.1038/s41586-024-07946-4